Ο Σταύρος Παπαθανάκης γεννήθηκε το 1961 στο Σπήλαιο Τριγώνου Έβρου. Είναι απόφοιτος του Ινστιτούτου Βιομηχανικών Μεταφραστών-Διερμηνέων στη Στουτγκάρδη και του Εργαστηρίου Επαγγελματικής Δημοσιογραφίας στην Αθήνα. Έχει ασχοληθεί επαγγελματικά με τον χώρο της τηλεόρασης, του ραδιοφώνου, του περιοδικού τύπου και των εκδόσεων, ενώ από το 2005 έχει αναλάβει τη Διεύθυνση της μηνιαίας επιθεώρησης κοινωνικής, πολιτιστικής και τουριστικής προβολής Βορέας. Είναι παντρεμένος με τη Φωτενή Αυτζή από την Πάλλη Τριγώνου, με την οποία έχουν αποκτήσει δυο παιδιά, την Αναστασία και τον Κωνσταντίνο.