Ο Μανώλης Μαραγκούλης αποφοίτησε από τη Φιλοσοφική Σχολή του ΑΠΘ, όπου παρακολούθησε το μεταπτυχιακό του τμήματος ΒΝΕΣ. Είναι διδάκτορας του Πανεπιστημίου Κύπρου. 
Δίδαξε νεοελληνική γλώσσα και πολιτισμό στο ισλαμικό πανεπιστήμιο του el-Azhar και του Καΐρου.
Συνεργάστηκε με τον Κωστή Μοσκώφ στην οργάνωση πολιτιστικής διπλωματίας στην Αίγυπτο από το 1993 μέχρι τον θάνατο του τελευταίου, το 1998. Εργάστηκε για μια εξαετία στην Αλεξάνδρεια ως Διευθυντής τού εκεί Παραρτήματος του Ελληνικού Ιδρύματος Πολιτισμού και της Οικίας-Μουσείου Κ.Π. Καβάφη. Διετέλεσε Πρόεδρος της Εφορείας του Μουσείου Φωτογραφίας Θεσσαλονίκης.
Έχει δημοσιεύσει πολλές μελέτες σε επιστημονικά περιοδικά και συλλογικούς τόμους. Μετέφρασε διηγήματα του Γιούσεφ Ιντρίς στον περιοδικό τύπο.