Το 1997, ίδρυσε την North American Wetland Engineering (NAWE), μια εταιρεία συμβούλων που επικεντρώνεται στην ανάπτυξη και εφαρμογή τεχνητών υγροτόπων. Έκτοτε, έχει σχεδιάσει πάνω από 200 συστήματα επεξεργασίας, η πλειονότητα των οποίων αφορά υγροτόπους. Η NAWE εξαγοράστηκε από τον Jacques Whitford το 2007 και ο Scott εργάζεται επί του παρόντος ως διευθυντής στον τομέα των υδάτινων πόρων για τον Jacques Whitford. Παρέχει υπηρεσίες συμβούλου για μια μεγάλη ποικιλία έργων στις Ηνωμένες Πολιτείες και διεθνώς.

Ο Scott δραστηριοποιήθηκε στην έρευνα και την ανάπτυξη, και κατέχει 5 διπλώματα ευρεσιτεχνίας για συστήματα επεξεργασίας λυμάτων, συμπεριλαμβανομένων των αεριζόμενων υγροτόπων υπόγειας ροής. Είναι εγγεγραμμένος επαγγελματίας μηχανικός σε 22 πολιτείες και έχει γράψει πολυάριθμα τεχνικά έγγραφα σχετικά με τους τεχνητούς υγροτόπους. Ο Scott ήταν ο κύριος ερευνητής για το Small-Scale Constructed Wetland Treatment Systems; Feasibility, Design Criteria, and O&M Requirements, ένα εγχειρίδιο σχεδιασμού, που δημοσιεύτηκε από το Water Environment Research Foundation (WERF) το 2006. Είναι ενεργό μέλος του IWA Specialist Group on the Use of Macrophytes in Water Pollution Control.