Η Ελεονώρα Ναξίδου είναι αναπληρώτρια καθηγήτρια της Νεότερης και Σύγχρονης Ιστορίας της Νοτιοανατολικής Ευρώπης στο Τμήμα Ιστορίας και Εθνολογίας του Δημοκρίτειου Πανεπιστημίου Θράκης. Πεδίο της έρευνάς της αποτελεί ο χώρος της Νοτιοανατολικής Ευρώπης κυρίως κατά τη νεότερη και σύγχρονη εποχή. Τα ερευνητικά της ενδιαφέροντα περιλαμβάνουν το φαινόμενο του εθνικισμού στα Βαλκάνια, την ανάπτυξη των εθνικών κινημάτων και τη συγκριτική τους προσέγγιση, καθώς και τις σχέσεις εκκλησίας και εθνικής ιδεολογίας. Ασχολείται επίσης με θέματα μειονοτήτων και ζητήματα που αφορούν τη νεότερη και σύγχρονη βουλγαρική ιστορία και ιστοριογραφία. Έχει λάβει μέρος σε πολλά διεθνή επιστημονικά συνέδρια. Επίσης έχει κάνει την επιμέλεια συλλογικών τόμων και έχει δημοσιεύσει πολλές μελέτες και άρθρα σε ελληνικά και ξένα περιοδικά.