Η δρ Άλκηστις Παπαϊωάννου είναι συντονίστρια και μέλος ΣΕΠ στο μεταπτυχιακό πρόγραμμα σπουδών Διοίκηση επιχειρήσεων (το ανοικτό ΜΒΑ) του Ανοικτού Πανεπιστημίου Κύπρου και συγκεκριμένα, στη Θεματική Ενότητα (ΘΕ) ΜΔΕ613 – Διοίκηση υπηρεσιών, μέλος ΣΕΠ στο Ελληνικό Ανοικτό Πανεπιστήμιο στο μεταπτυχιακό πρόγραμμα σπουδών Διοίκηση αθλητισμού και διδάσκει περισσότερα από 18 χρόνια σε προπτυχιακό και μεταπτυχιακό επίπεδο στην Ελλάδα και στην Κύπρο. Πιο συγκεκριμένα, έχει διδάξει και εξακολουθεί να διδάσκει αθλητική διοίκηση σε μεταπτυχιακό επίπεδο στο Ελληνικό Ανοικτό Πανεπιστήμιο και στο Πανεπιστήμιο Πελοποννήσου, στο Δημοκρίτειο Πανεπιστήμιο Θράκης και διοίκηση τουρισμού στο Ελληνικό Ανοικτό Πανεπιστήμιο και στο Πανεπιστήμιο Πατρών. Επίσης, έχει διδάξει (σε 7 Τμήματα του Πανεπιστημίου Πελοποννήσου) και εξακολουθεί να διδάσκει διοίκηση επιχειρήσεων σε προπτυχιακό επίπεδο, στο Πανεπιστήμιο Δυτικής Αττικής και στο Ανοικτό Πανεπιστήμιο της Κύπρου. Τα ερευνητικά της ενδιαφέροντα περιλαμβάνουν τη διοίκηση ανθρώπινου δυναμικού και θέματα επιχειρηματικότητας–καινοτομίας και στρατηγικής διοίκησης που εφαρμόζονται σε οργανισμούς και επιχειρήσεις παροχής υπηρεσιών. Έχει δημοσιεύσει μεγάλο αριθμό άρθρων σε διεθνή και ελληνικά επιστημονικά περιοδικά, καθώς και σε πρακτικά διεθνών και ελληνικών συνεδρίων. Επιπλέον, το συγγραφικό της έργο περιλαμβάνει βιβλία και κεφαλαία σε βιβλία και συλλογικούς τόμους στον τομέα της διοίκησης και του μάρκετινγκ, καθώς και ομιλίες σε στρογγυλές τράπεζες. Επίσης, έχει επιβλέψει και εξακολουθεί να επιβλέπει μεταπτυχιακές διατριβές σε θέματα διοίκησης που εφαρμόζονται σε οργανισμούς και επιχειρήσεις παροχής υπηρεσιών, ενώ αξιολογεί επιστημονικά άρθρα που υποβάλλονται σε διεθνή και ελληνικά επιστημονικά περιοδικά. Παράλληλα με τις διδακτικές και ερευνητικές της δραστηριότητες, συμμετέχει ενεργά σε διάφορα ερευνητικά έργα (περισσότερα από 15) —πολλά από τα οποία συγχρηματοδοτήθηκαν από την ΕΕ— σε τομείς που σχετίζονται με τα ακαδημαϊκά της ενδιαφέροντα, ενώ έχει εργαστεί ως σύμβουλος σε σημαντικούς αθλητικούς και τουριστικούς φορείς στην Ελλάδα.