H Μαργαρίτα Πουρνάρα γεννήθηκε στην Αθήνα. Τελείωσε Γαλλική Φιλολογία στο ΕΚΠΑ αλλά ήδη πριν την αποφοίτηση είχε άρχισε να εργάζεται ως δημοσιογράφος στην τηλεόραση. Έκανε μεταπτυχιακές σπουδές ΜΜΕ στο City University του Λονδίνου το 1996. Επιστρέφοντας επισης εργάστηκε στο ραδιόφωνο, τα περιοδικά και στην εφημερίδα «Το Βήμα». Από το 1999 ως σήμερα είναι μέλος της σύνταξης της εφημερίδας «Καθημερινή», με ειδίκευση στο πολιτιστικό ρεπορτάζ και ιδίως τα εικαστικά. Από το 2017 έχει τη στήλη «Αθηναϊκά» και αρθρογραφεί σε μια ευρεία γκάμα, από τη γαστρονομία και τα ταξίδια μέχρι και το ελεύθερο ρεπορτάζ.
Το 2010 κέρδισε την υποτροφία Fulbright και εκπόνησε έρευνα για την νέα γενιά Ελληνομερικάνων στο Queens College της Νέας Υόρκης.
Από το 2014 εξειδικεύτηκε στις ζωντανές συνεντεύξεις παρουσία κοινού.
Από το 2023 παρουσιάζει μια φορά το μήνα το προφίλ μιας πόλης ή ενός νησιού στην κυριακάτικη «Κ» με τίτλο «Αθέατη Ελλάδα».