Ο Μάρλιν, ένα ψάρι κλόουν, και ο γιος του, ο Νέμο, ζούσαν μια ήσυχη ζωή στο Μεγάλο Κοραλλιογενές Φράγμα. Ο Μάρλιν ήταν υπερπροστατευτικός πατέρας, προς μεγάλη απογοήτευση του Νέμο, που ονειρευόταν περιπέτειες. Όμως μια μέρα ο Νέμο απομακρύνθηκε αρκετά από το Φράγμα και αιχμαλωτίστηκε από έναν δύτη! Χωρίς να χάσει καιρό, και παρά τον φόβο του για τον μεγάλο ωκεανό, ο Μάρλιν έφυγε προς αναζήτηση του γιου του, παρέα με την Ντόρη, ένα ψάρι με μεγάλη καρδιά, αλλά με αδύναμη μνήμη...