Το βασικό πρόβλημα στις ελληνοαλβανικές σχέσεις υπήρξε πάντοτε το γεγονός ότι και οι Έλληνες και οι Αλβανοί διεκδικούσαν ουσιαστικά την ίδια περιοχή, την Ήπειρο. Αυτό το πρόβλημα προέκυψε από τη συνήθεια που είχαν οι Τούρκοι να κατατάσσουν τους λαούς ανάλογα με την θρησκεία τους. Έτσι τους Αλβανούς, που ανήκαν στην Ορθόδοξη Εκκλησία, τους θεωρούσαν Έλληνες, ενώ τους μουσουλμάνους τους κατέτασσαν στους Τούρκους...
Σημαντικό επίσης υπήρξε το γεγονός ότι η τουρκική εξουσία στην Ήπειρο, καθώς την ασκούσαν αποκλειστικά μουσουλμάνοι Αλβανοί, απέβλεπαν στη σκόπιμη σύγχυση των ορίων Ηπείρου και Αλβανίας, με τρόπο που έθιγε τα ελληνικά συμφέροντα στην Ήπειρο...
Αυτοί οι δύο παράγοντες, ταύτιση της εθνικότητας με τη θρησκεία και ανάμιξη των λαών, οδήγησε τους Έλληνες και τους Αλβανούς στη διεκδίκηση ουσιαστικά της ίδιας περιοχής